Na temelju članka 31. stavka 4. Zakona o Vladi Republike Hrvatske (NN 150/2011) i članka 4. stavka 3. Uredbe o Hrvatskoj poljoprivrednoj agenciji (NN 63/94, 93/96, 11/97, 48/2000, 8/2001, 78/2003 i 28/2009), Vlada Republike Hrvatske je na 21. sjednici održanoj 19. travnja 2012. godine donijela Rješenje o imenovanju predsjednice i člana Upravnog vijeća Hrvatske poljoprivredne agencije.
Upravno vijeće Hrvatske poljoprivredne agencije djeluje u sastavu:
1. prof. dr. sc. Vesna Gantner – predsjednica Upravnog vijeća
2. prof. dr. sc. Pero Mijić – član Upravnog vijeća
3. Damir Vinković, dipl. ing. – član Upravnog vijeća

Sukladno Statutu Hrvatske poljoprivredne agencije, nakon provedenog javnog natječaja Upravno vijeće Hrvatske poljoprivredne agencije je na prijedlog Ministra poljoprivrede, ribarstva i ruralnog razvoja, na sjednici održanoj 6. travnja 2009. godine, za ravnatelja Hrvatske poljoprivredne agencije imenovalo mr. sc. Zdravka Baraća, dipl. ing. agr.